SLiM töötuba – Evolutsiooniliste simulatsioonide modelleerimine

📍Tartu Ülikooli raamatukogu (W. Struve 1, Tartu)

Üritus toimub inglise keeles.

Mis on SLiM? 
SLiM on võimas tarkvarapakett individuaalipõhiste, geneetiliselt täpsete evolutsioonisimulatsioonide läbiviimiseks. See on paindlik, skriptitav ja kiire, pakkudes interaktiivset graafilist modelleerimiskeskkonda, mis teeb sellest ideaalse tööriista väga erinevate evolutsioonistsenaariumide uurimiseks. 

Milleks saan SLiM-i kasutada? 
SLiM võimaldab edasisuunalisi geneetilisi simulatsioone, modelleerides üksikorganisme ja nende genoomi ajas alates algseisundist. Seda saab kasutada näiteks: 

• Spetsiifiliste (ja suvaliselt keerukate) demograafiliste stsenaariumide (nt pudelikaelad, populatsiooni kasv, valik) korral eeldatavate genoomsete mustrite uurimiseks. 
• Neutraalsete simulatsioonide läbiviimiseks nullmudelite loomiseks. 
• Simuleeritud andmete genereerimiseks masinõppe klassifikaatorite treenimiseks, et eristada erinevaid demograafilisi stsenaariume, kui neid rakendatakse pärisandmetele. 
• …ja palju muud! 

Töötoa ülesehitus: 
See viiepäevane töötuba käsitleb peamisi teemasid SLiM-i käsiraamatust — alustades sissejuhatusest SLiM-i ja selle skriptimiskeelde Eidosse ning liikudes edasi keerukamate teemadeni. 

Põhisisu mahub nelja päeva sisse, viies päev on avatud modelleerimisajaks, kus osalejad saavad töötada oma projektidega. 

Töötuba viib läbi Ben Haller, PhD (Cornelli Ülikool).
Üldine töötoa info: https://benhaller.com/workshops/workshops_attendees.html
Töötoa sisu: https://benhaller.com/workshops/workshops_overview.html

Registreeru SIIN.
Maksimum osalejate arv on 30. Osalejad valitakse registreerumise järjekorra alusel.

Küsimuste korral palume pöörduda Jose Rodrigo Flores (rodrigo.flores@ut.ee) poole.

Eesti doktorikooli loodusteaduste ja põllumajandusteaduste haru.